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新方法可更好“拼写检查”基因序列

来源:科学网
摘要:据美国物理学家组织网报道,来自澳大利亚联邦科学与工业研究组织和昆士兰大学的研究人员发明了一种方法,可以更好地对基因序列进行“拼写检查”。这将有助于生物学家更好地理解自然世界,相关研究论文发表在近期的《自然—方法学》上。Bragg等用该软件特别地检查了微生物基因的重要部分——扩增子。就像计算机的拼写检查......

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据美国物理学家组织网报道,来自澳大利亚联邦科学与工业研究组织和昆士兰大学的研究人员发明了一种方法,可以更好地对基因序列进行“拼写检查”。这将有助于生物学家更好地理解自然世界,相关研究论文发表在近期的《自然—方法学》上。

 

博士生Lauren Bragg等在Gene W Tyson带领下,研发出一款软件——Acacia。Bragg等用该软件特别地检查了微生物基因的重要部分——扩增子。就像计算机的拼写检查程序查找单词拼写错误一样,Acacia发现了扩增子在基因表达过程中出现的密码子错误。

 

Acacia较目前生物学家使用的两款纠错工具具有明显的优势,并且更容易使用。

 

“此研究告诉国际生物界,现在有一款新软件,可以快速、可靠地进行基因序列纠错。”Bragg说。

作者: 2012-5-15
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