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尿路结石的真正成因相当复杂，医界至今并不能百分之百的确定，但可以确定的是有些内外在因素，的确左右着尿路结石的发生，像内在因素的泌尿系统本身解剖构造异常、感染发炎、新陈代谢失调等；外在因素如的年龄、性别、环境、季节、气候、饮水、食物、职业等，统统都算是形成尿路结石的原因。
● 内在因素
1. 罹患疾病：副甲状腺机能亢进症、手术外伤所造成的尿路狭窄、长期卧床者。
2. 泌尿系统：经常性泌尿道感染发炎、经常性尿滞留、尿路环境改变。
3. 服用药物：服用利尿剂、阿斯匹灵、抗痛风药物等药物。
● 外在因素
1. 遗传因素：通常白种人比黑种人易罹患结石，因此产生结石的机率与皮肤黑色素有关的说法，认为黑色素能阻挡紫外线，减少维生素D的活化，进而降低肠道对钙质的吸收。再者，有尿路结石家族史者，其罹病机率较平常人提高三倍，也就是说为尿路结石的高危险群。
2. 年龄和性别：尿路结石好发于三十至五十岁的中年人身上，小孩及老人较少发生；而男性罹患机率约是女性的二至三倍，其真正原因不明。
3. 季节因素：夏季是尿路结石的“旺季”，这可能与夏季排汗多，相对使尿量变少、尿中草酸钙浓度变高有关；另外夏季时民众通常会食用较多的蔬菜与水果，这也会使尿中草酸变多，自然增加结石发生的可能。
4. 饮食因素：过度摄取乳酪制品、富含草酸的食物，如菠菜、咖啡、茶、巧克力、核桃，其维他命C、维他命D会导致钙石的形成。而大量食用嘌呤食物（贝类、海鲜）也会导致尿酸石形成。
5. 职业及生活型态：在高温环境下工作者较易得尿路结石，理由和季节因素类似；少运动的白领阶级和暴饮暴食者，结石率也较高。有项数据统计指出，坐办公桌的白领阶级，其罹患尿路结石的机会是农夫的二十四倍。