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一、孤独症的病因：
目前对孤独症的病因说法颇多，但多数专家学者认为是由基因遗传所致，人体共有23对染色体，10万个基因，30亿个碱基对，第22对染色体上约有6000万个碱基对，是23对染色体中最小的一对，虽然较小，但它是基因种类最丰富的染色体，也是最活跃的致病染色体，免疫反应，精神病，脑发育迟缓（包括儿童孤独症、弱智、痴呆）与它的基因变异有关。孤独症的发病是遗传基因变异，如果基因不变异，就是有遗传基因存在，也不会发生孤独症，如癌症，每个人体中都有癌细胞，为何少数人发病，同样是因为免疫力降低和基因变异所致。变异基因是哺乳动物生物钟的核心成份，这种变异基因是CHIdelta，人类遗传基因疾病已发现已有5000多种，目前只破译200多种，现在世界各国相关科学家都参予了基因图谱绘制工作，如全部绘制完成，人类健康史将翻开新的一页，如果进行基因治疗，目前任何治疗都会相形见拙，黯然失色。今后彻底治愈孤独症，还是要最好最有效的基因治疗方法，而非单纯的说教训练就能彻底治愈的，比如多数患儿存在睡眠问题，又如何训练？正常儿童到睡觉时你不让孩子睡也是不行的，孤独症患儿你让他正常睡觉他也不睡，不治疗又怎么行?睡眠不好各种病态都会加重，根本不服从指令，训练又会有多大效果呢？再有一部分患儿连大小便都不能自理，经常便到裤子上，又如何训练呢？
另一项研究已指出第15对染色体异常的人，较易出现恐慌和焦虑失调症，加拿大多伦多大学遗传学者斯蒂芬.希勒等人的最新研究显示，孤独症可能同患儿7号染色体上的基因顺序紊乱有关，因此得出结论，儿童孤独症的病因与人第7对、15对、22对染色体异常有密切相关。
二、如何基因治疗和避免孤独症患儿发生：
既然是染色体异常所致，就要对孕期准妈妈定期产前筛查，是否有染色体异常，发现染色体异常情况应及早治疗。据美国一个科研小组称，他们研发了一种可以打开和关闭治疗基因的方法，这样让基因治疗更安全、更有效。治疗基因有时会因活性过强产生毒付作用，并引起免疫系统对传送基因的载体病毒的不良反应，必须在一种新型基因转移载体中设计基因开关，才能克服基因疗法这些障碍，治疗基因要在抗生素的参与下打开和关闭，当不需要治疗时，用一种“消声器”的特殊蛋白质能彻底关闭治疗基因。基因治疗是一种尖端的、刚刚问世的一种全新疗法，就目前情况还不能开展这项治疗，美国的科研小组也是一项设想治疗。如不能治疗，应采取断然措施，终止妊娠，对防止孤独症的发生有着重要意义。
三、基因排列失序和基因遗传的方式：
基因排列失序有两种说法，一种是引发疾病，另一种说法是人类“大跃进”的动力，说不定会出现特异功能，产生音乐家和天才物理学家，这要看基因排列图谱当中到底是在哪里颠倒了排列顺序而定。
人的机体就是一个巨大的细胞集合体，而每个细胞都包含着作为一个人的完整基因，人类繁衍就是传播基因，通过精子、卵子由一个机体转到另一个机体，这种人类繁衍方式就是基因的延续（遗传）。
四、基因突变说：
我们的精神世界就是受到进化的生物基因的不断遗传，有时人类基因会产生突变，如癌症、爱滋病等，虽然使一部分人的生命过早终结，但本身也会使人产生免疫力，所以人类才能不断的繁衍下去。
今天，世界上各类精神疾病在不断增加，包括儿童孤独症。韩国媒体披露，有10％的儿童患有各类儿童心理疾病，欧美、日本惊呼约20％儿童患有心理疾病（包括儿童孤独症）。人类的文明进程与文明发展，再不是日出而作、日落而息、掘井而饮的自然环境，人们受到了农药、化肥、噪音等多种污染，今天的文明环境正在日益恶化，这也是促成了人类心理疾病不断上升的重要原因。
五、孤独症的治疗与训练：
任何疾病都需要治疗，孤独症当然也不例外，选择安全、无毒付作用的康复疗法至关重要，孤独症患儿绝大多数都存在睡眠问题，为何西方国家对较重的患儿给服用一定数量的氟哌啶醇等精神科强力安眠药，这就说明恢复患儿良好睡眠的重要性，然而服用这类精神科药物，患儿家长和医生均了解这类安眠药的毒付作用和后果，所以寻求中医疗法恢复良好睡眠就显得十分重要，应用中医疗法，无毒、无付作用，可全面康复。
对于训练的认识，根据我们近四十年总共对2700多例患儿治疗的经验看，必须先治疗，患儿有一定的接受能力，再训练效果比较好，或是治疗到中期以后，治疗和训练并举，才能取得最佳效果，以往治疗的患儿，按疗程治疗，按疗程巩固，没经过训练，上正常小学读书的不胜枚举，这充分的说明治疗的重要性，如果按西方国家的训练方法，需终生训练，从国外回来治疗的儿童，家长讲述学龄前进行单独感统训练，到入学时，大部分不能入学，继续进行感统训练，既使一小部分能上学，也是在正常小学内开设特教班，由国家拔款，老师和患儿一对一的长期特教，这样的学习没有指标，学啥样算啥样，实际上是不能和正常孩子接受正常教育，而我们通过治疗的患儿能融入正常学校接受教育，当然中医治疗也不是一朝一夕就能治愈的，也需要一定疗程治疗和巩固治疗。使患儿对事物能加深理解和分析的能力，2004年从山东来治疗的一个孩子，刚刚训练完毕，在草坪上一边踩嘴里一边念叼，老师说了踩草坪不是好孩子，训练时老师是教会了他这句话，然而却不理解其意，如你理解了就不会一边说一边踩草坪。单纯训练大多数患儿还是个废人，给社会和家庭带来更大负担，我们期望以治疗为主、训练为辅完美的结合，多种治疗方法才能兼收并蓄，而不是互相排斥。