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线虫自动成像分类系统研制成功

来源:科学时报
摘要:研究人员在日前在线出版的《自然—方法学》(NatureMethods)期刊上报告说,他们发明了一种可以对线虫进行自动成像和分类的系统。这种方法需要对大量的动物进行监督,而且需要借助于快速和自动的方法。HangLu和同事发明并试验了一种新系统,它能自动生成高清晰度的秀丽隐杆线虫图像,并对其进行分类。秀丽隐杆线虫是一种......

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  研究人员在日前在线出版的《自然—方法学》(Nature  Methods)期刊上报告说,他们发明了一种可以对线虫进行自动成像和分类的系统。

  遗传筛选是一种经典方法,常用于模式动物组织遗传物质和新特征或有趣特征的鉴别。这种方法需要对大量的动物进行监督,而且需要借助于快速和自动的方法。这种系统的一个主要挑战是需要将最新技术与快速扫描结合起来。

  Hang  Lu和同事发明并试验了一种新系统,它能自动生成高清晰度的秀丽隐杆线虫图像,并对其进行分类。秀丽隐杆线虫是一种常用的模式动物。他们研制了一种由计算机软件控制的微流体芯片,即使很小的变异该芯片也能捕捉,并且能在单细胞水平的差距上对线虫进行分类,这种方法不仅快速、准确,而且不需要人为介入。

  这是首次将高清晰度成像技术与自动分类技术结合起来的自动设备,会促进未来更高效的模式动物遗传筛选技术的出现。



研究人员在日前在线出版的《自然—方法学》(Nature  Methods)期刊上报告,他们设计了一套系统,可以自动生成,从而能监督像秀丽隐杆线虫(简称线虫)胚胎发育过程中的基因表达。

发育生物学的主要目标是了解单个受精卵分裂成多个细胞的发育过程。这将有助于鉴别细胞发育阶段所表达的每个基因。线虫是一种理想的发育生物学研究模式动物,因为它既透明又简单,而且它的发育过程已经被定义。

Waterston和同事用一种自动成像方法来监测四种有荧光指标的基因的表达时间和表达水平,每种基因都负责编码线虫胚胎中一种重要的转录因子。他们精确鉴别出350多个细胞发育过程中的相关基因表达,基本上涵盖了胚胎的整个细胞分裂过程。

新方法为系统分析更多基因的受体奠定了基础,它将有助于揭示细胞分裂每个过程中的基因表达。
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