果蝇Y染色体上基因增加远远超过基因丢失

染色体组织在演化上基本上是稳定的。在果蝇中，超过95%的基因仍然保留在距今大约6300万年前分化的12个物种中的同一染色体臂上。然而，对Y染色体所做的一项研究显示，黑腹果蝇与Y染色体相关的基因中只有1/4在其他11个所测序的物种中也与Y染色体相关。与以退化及基因丢失为特征的哺乳动物Y染色体形成对比的是，果蝇Y染色体上的基因增加与基因丢失相比超过10比1。