科学家利用新方法发现广泛分布于人类肠道中的新病毒

近日，美国圣地亚哥州立大学 Robert Edwards 率领的研究团队利用新策略，从人类粪便样品中发现了一种广泛分布于人类肠道的新病毒。这种新方法给科学家研究人体微生物群提供了一条非常有效的新思路。

传统手段要发现新的微生物，需要先将其在体外单独培养。肠道病毒由于只能存活于肠道细菌中，而后者的培养相当困难，使得它们的发现也有相当的难度。随着近代高通量测序手段的发展，人们能够测定样品中所有微生物基因组片段，然后通过拼接这些片段来发现新的微生物。然而，这种方法仍有不足——拼接短片段的时候需要有已知的微生物基因组作为参考，所以对于全新的微生物而言并不适用。

这次 Edwards 团队发表在《自然·通讯》上的研究给出了一种新的思路：如果某些基因片段在各个样品之中都出现，那么它就更有可能是属于同一套微生物的基因组。他们通过交叉比对来自不同样品的基因片段，找到那些多次出现的片段，组装成了一套新的微生物基因组。之后又根据其特征，推断出这种新病毒可能是一种噬菌体，并且在样品中找到了它可能的细菌宿主。由于人体粪便样品的基因片段中的未知部分超过七成，这一思路可能会给人们对它们的研究带来很大助益。