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作为DNA采集来源 指甲还有待验证

来源:生物探索/千人智库
摘要:传统上,研究人员都是将血液作为DNA的来源,探讨流行病学中的遗传因素。然而,这种生物样本代价昂贵,因为其采集、运输和长期保存的难度。随着解析方法的改进,对DNA的需求数量减少了。在脸颊、细胞、尿液、粪便、唾液、嚼过的口香糖、头发和指甲中,DNA含量相对较少,引起了......

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传统上,研究人员都是将血液作为DNA的来源,探讨流行病学中的遗传因素。然而,这种生物样本代价昂贵,因为其采集、运输和长期保存的难度。随着解析方法的改进,对DNA的需求数量减少了。在脸颊、细胞、尿液、粪便、唾液、嚼过的口香糖、头发和指甲中,DNA含量相对较少,引起了许多研究者的兴趣。

美国加利福尼亚大学Hannah Lui Park等学者在科研出版社2015年1月英文期刊《Open Journal of Epidemiology》(流行病学期刊)上发表了一项研究。研究中,为了使用少量人类的指甲进行基因分型的可行性实验分析,需要确定指甲中DNA和双链DNA(dsDNA)的数量和纯度,评价聚合酶链反应(PCR)的最大扩增子大小,并确定基因分型的成功率、一致性。

从研究结果看,在许多样本中含有高浓度的单链DNA或RNA,吸光度比值显示了污染物的存在:蛋白质、酚和/或其他物质。从PCR和电泳(Electrophoresis)来看,高浓度的盐可能已经阻碍了扩增反应,当扩增子大小增加到600bp时,成功率下降到79%,当大小至少为900bp时,只有50%的样品被成功扩增。学者还讨论了全基因组扩增前后的单核苷酸多态性基因分型。

平均而言,剪下的每毫克(mg)指甲里,总共可以收集到大约90纳克(ng)的DNA,这已足够用于10多个单核苷酸多态性基因分型反应。剪下的指甲有许多的优点,包括非创伤性收集,可以自行收集,无需收集工具包或研究人员的援助,简单、低成本,可以在室温条件下长期保存。

但从指甲中提取DNA过程更艰苦,DNA易受污,会影响之后DNA的扩增和分析。虽然指甲为DNA的提取提供了又一来源,但学者观察到,相对于血液或唾液中,指甲中的基因分型成功率较低。此外,由于碎片化了,指甲DNA不适合长期的PCR扩增,因此该来源虽可行,但仍需进一步努力。

原文链接http://www.scirp.org/journal/PaperInformation.aspx?PaperID=53415

作者: 2015-1-27
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