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H7N9病毒可能源自华东禽类

来源:新闻晚报
摘要:记者今天上午获悉,复旦大学公共卫生学院青年教师熊成龙、张志杰等以先进的生物信息学为手段,对本次H7N9禽流感病毒基因进行研究和分析,终于找到了该病毒的起源和演化规律,即首次发现该病毒的2个最重要蛋白HA和NA并非如此前中外学术界专家所认为的“分别来源于中国和韩国禽类”,而是起源于中国华东地区的家禽或野鸟。......

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记者今天上午获悉,复旦大学公共卫生学院青年教师熊成龙、张志杰等以先进的生物信息学为手段,对本次H7N9流感病毒基因进行研究和分析,终于找到了该病毒的起源和演化规律,即首次发现该病毒的2个最重要蛋白HA和NA并非如此前中外学术界专家所认为的 “分别来源于中国和韩国禽类”,而是起源于中国华东地区的家禽或野鸟。该成果对今后预防和溯源流感与禽流感有重要意义,近日相关论文已在线发表在国际传染病领域著名期刊美国《临床感染病》杂志。

  熊成龙、张志杰研究团队认同中外学术界专家对HA来源的报道,但对NA来源则有异议。

  核苷酸是构成基因的最基本单位,氨基酸是构成蛋白的最基本单位,对核苷酸和氨基酸的同源进行分析,就能够搞清楚病毒的起源和演化规律。为此,熊成龙、张志杰研究团队分析了全球共享的流感数据库中 (包括本次病原代表株H7N9病毒以及2006—2011年的7株韩国株NA亚型株在内)长度大于1000核苷酸的N9基因序列共321个NA序列,并由此推导出相应的蛋白质氨基酸序列,最终证实,H7N9禽流感病毒的最重要蛋白HA(N9基因)来源于中国江苏洪泽湖花脸鸭 (即H11N9病毒株),即NA蛋白并非来源于韩国。

  熊成龙、张志杰研究团队认为最重要的依据是,从基因的核苷酸和蛋白质氨基酸序列相似性搜索结果来看,H7N9病毒的最重要蛋白 NA与 H11N9病毒在核苷酸和氨基酸层次上序列的相似性分别是96.2%和96.8%;而7株韩国株 NA亚型株相似性分别在93.3%至95.5%和87.9%至96.4%。前者远高于后若干者。熊成龙、张志杰研究团队研究还认为,杭州是H7N3病毒的分离地,也是此次流感流行的主要疫区之一,洪泽湖是中国第四大淡水湖,是水禽的主要栖息地之一,也是H11N9病毒的分离地,也就是说,从本次流感最初发生地、H7亚型HA贡献株分离地,以及H11N9病毒分离地点来看,均位于中国的华东地区,从地理位置上来看,病毒株发生重组的可能性也远高于韩国株。

作者: 2013-5-24
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