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原位聚合酶链式反应(in situ PCR)和原位反转录聚合酶链式反应(in situ RT-PCR)操作规程

来源:医学加加
摘要:(一)、仪器设备英国ThermoHybaid原位PCR仪。(二)、操作流程1、原位PCR步骤1)预处理:(1)切片常规脱蜡。2mol/LHCl处理10min。(3)5μg/ml蛋白酶K消化组织37℃10min。...

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  (一)、仪器设备

  英国Thermo Hybaid原位PCR仪。

   (二)、操作流程

   1、原位PCR步骤

  1)预处理:

  (1)切片常规脱蜡;

  (2)0.2mol/L HCl处理10min;

  (3)5μg/ml蛋白酶K消化组织37℃10min;

  (4)Nase消化组织37℃ 30min;

  (5)梯度酒精脱水,室温干燥。

  2)原位扩增:

  (1)切片滴加特异性序列引物30μLPCR扩增反应液,覆盖硅化盖玻片,石蜡油封边;

  (2)PCR热循环:94℃,1min;55℃,1min;72℃,1.5min,共25~30个循环,72℃延伸10min;

  (3)氯仿洗去盖玻片,4%多聚甲醛后固定10min,梯度酒精脱水,干燥。

  3) 原位杂交:

  (1)加地高辛标记探针的杂交液,98℃变性10min,-20℃退火5min,42℃杂交过夜。

  (2)杂交后用2×SSC洗涤10min,3次,1×SSC洗涤10min,3次;

  (3)缓冲液洗涤10min,3次;

  (4)加碱性磷酸酶标记的羊抗地高辛抗体复合物,37℃,2h;

  (5)缓冲液洗涤5min,3次;

  (6)NBT、BCIP暗处显色,镜下控制,终止显色。

  (7)常规脱水:透明、封固。

    2、原位RT-PCR步骤

  1)预处理:

  (1)蛋白酶K(0.3mg/mL) 54℃消化20min,蒸馏水洗;

  (2)95℃加热3min,灭活残存的蛋白酶。

  2)原位扩增:

  (1)在有RNA酶抑制剂存在的条件下,用随机六聚物进行逆转录反应;

  (2)用热启动法进行PCR扩增。标本加热至75℃时加上反应液,覆以盖玻片,四周用指甲油密封。然后将温度升至95℃,2min。再将热循环仪设定为95℃,45s,55℃,1min和75℃,45s,共26次循环;

  (3)扩增结束后,在80℃烤15min~30min。

  3)原位杂交:

  (1)杂交前标本95℃加热3min;

  (2)加上杂交液,湿盒内50℃过夜;杂交液组成:25%硫酸葡聚糖,2×SSC,50%甲酰胺,0.33mg/ml变性的鲑鱼精子DNA, 每0.5mL杂交液内含生物素标记探针1ng。

  (3)扩增的β-肌动蛋白和IL-6用DAKO检测试剂盒K600(链霉卵白素,生物素标记的碱性磷酸酶和硝基四氮唑蓝)检测。阳性反应呈紫色。

作者: 2007-9-25
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