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乳腺癌的超微结构主要表现为癌细胞核增大,而细胞浆变小,仅为薄薄的一层,围绕着核的边缘;核的形态不规则,严重畸形,核膜可从侧面内陷成沟;细胞核内染色质增多,还可见到一些特殊颗粒如核小体、染色质周围颗粒及核质间颗粒等。细胞浆内细胞器增多,特别是粗面内质网明显增多且出现不同程度的膨胀;线粒体变大,线粒体内嵴变少,排列紊乱,甚至消失;还可见到蜂窝状分泌粒等。细胞膜上桥粒少且分化差;多无基底膜。
由于超微结构检查费用较高,操作相对比较复杂,且临床通过光镜检查已能比较准确地作出形态学诊断,故不宜作为乳腺癌的常规检查手段,目前仅作为研究之用。