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(1)直接定位诊断法：包括输尿管导尿法、膀胱冲洗法、肾活体组织检查三种。这几种方法虽很准确，但均属创伤性检查，且操作麻烦，不适于临床应用。
(2)间接定位诊断法：尿抗体包裹细菌检查(尿ACB检查)。此法具有高度的敏感性和特异性，但也有少数病人出现假阳性或假阴性。其中假阳性见于：①尿液被阴道分泌物或粪便菌丛污染；②细菌来自前列腺炎；③并发膀胱肿瘤、结石及出血性膀胱炎；④上次肾盂肾炎产生的抗体包裹了新近膀胱炎的细菌。尿ACB假阴性见于：①细菌在体内存活时间太短；②细菌表面包有粘液样物质，使抗体不能与细菌接触；③尿中抗体未达到荧光抗体测定所需的量。总之，尿ACB 检查结果：①尿ACB 阳性不是单纯性膀胱炎，而是肾盂肾炎、前列腺炎或结石、肿瘤并发的膀胱炎和出血性膀胱炎； ②尿ACB阴性多属单纯性膀胱炎。尿β2微球蛋白测定：肾盂肾炎尿β2微球蛋白均增高，膀胱炎一般为正常。核素肾图检查：如确诊为尿路感染而无尿路梗阻者，放射性肾图异常所见，对区别膀胱炎与肾盂肾炎是一个简易而有效的诊断方法。并可观察治疗后肾功能的改变情况。尿酶学检查：尿溶菌酶阳性为肾盂肾炎，膀胱炎尿白细胞多时会有假阳性。
其余检查还有肾最大浓缩功能测定，X 线及超声检查等，可靠性不大，但与其他几种同时检查可提高诊断的可靠性。