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中国南方汉族群体HLA-A2基因亚型分析

来源:中国免疫学杂志
摘要:中国南方汉族群体HLA-A2基因亚型分析中国免疫学杂志2000年第4期第16卷遗传免疫学作者:田伟李立新郭实士程文陈继嵩孙科柱单位:田伟(湖南医科大学免疫研究室,长沙410078)。孙科柱(湖南医科大学免疫研究室,长沙410078)中国图书分类号R392。2HLA-A2是一种主要HLAI类抗原,正式命名的等位......

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中国南方汉族群体HLA-A2基因亚型分析

中国免疫学杂志 2000年第4期第16卷 遗传免疫学

作者:田伟 李立新 郭实士 程文 陈继嵩 孙科柱

单位:田伟(湖南医科大学免 疫研究室,长沙 410078);李立新(湖南医科大学免 疫研究室,长沙 410078);郭实士(湖南医科大学免 疫研究室,长沙 410078);程文(湖南医科大学免 疫研究室,长沙 410078);陈继嵩(湖南医科大学免 疫研究室,长沙 410078);孙科柱(湖南医科大学免 疫研究室,长沙 410078)

  中国图书分类号 R392.2

  HLA-A2是一种主要HLA I类抗原,正式命名的等位基因(截止1997 年)达 22种[1],本文初步调查了中国南方汉族群体HLA-A2等位基因亚型分布。

  1 材料与方法

  1.1 研究对象 40名随机选择、无血缘关系的健康汉族个体来自湖南长沙 地区。

  1.2 主要试剂 HLA-A2亚型ARMS-PCR分型引物试剂盒(Dynal公司,批号 :A625)及A*0201(阳性对照),A*3101(阴性对照)标准DNA由美国Baylor大学罗亚敏博士 赠送。

  1.3 外周血白细胞基因组DNA抽提 同文献[2]。

  1.4 PCR扩增基因组DNA筛选HLA-A2阳性标本 PCR引物E21、E22、E31序列 同 文献[3],由美国Genosys公司合成。用E21、E31引物作HLA-A座位类扩增,用E2 2、E31引物做HLA-A2特异性扩增。PCR循环68℃退火1 min,其余参数同文献[3] 。结果HLA-A2阳性样本两组扩增中均有830 bp的PCR产物条带;HLA-A2阴性标本 仅在 类扩增中有830 bp的PCR产物条带。每批筛选同时做HLA-A2阳性、阴性DNA对照,采用单盲 法重复筛选全部样本。

  1.5 ARMS-PCR做HLA-2亚型分析 每份HLA-A2阳性样本同时做24管ARMS -PCR反应以测定所含亚型。具体操作参照试剂盒所附实验手册。所用ARMS-PCR分型试剂盒 可测定HLA-A*0201至A*0222等22种亚型。

  1.6 PCR产物直接测序 采用Taq DyeDeoxy Terminator Cycle Sequencing Kit在PE 9600型基因扩增仪上完成测序反应,在ABI377型测序仪上自动测序。

  1.7 统计学分析 等位基因频率计算按文献[4]。

  2 结果

  在全部40例样本中筛选出20例HLA-A2阳性样本,HLA-A2基因频率为0.293,检出A*0201 、A*0203、A*0206、A*0207和A*0211等5种HLA-A2基因亚型,其中A*0201占45%( 9/20),各亚型频率详见表1。

表1 中国南、北汉族群体HLA-A2基因亚型构成比较

  Tab.1 Comparison of HLA-A2 allelic distribution

  between southern and no rthern Chinese Han populations

Allele Southern Chinese Han

  (40 samples)

Northern Chinese Han

  (66 samples)[5]

n af(%) g f(%) n af(%) gf(%)
0201 9  22.5  12.0 0 19  28.8  16.7
0203 3 7.5 3.82  2 3.0 1.5
0206 3 7.5 3.82 10 15.2 7.6
0207 4 10.0 5.13  7 10.6 5.3
0211 1 2.5 1.26

  Note:n.number of individuals having the specific allele;af.antigen fre quency;gf.gene frequency3 讨论

  根据HLA-A2基因亚型DNA序列差异可分为A*0201和A*0205两大亚群,A*0201见于所有 被调查人群,A*0203、A*0206、A*0207、A*0210仅见于东方人:另一方面,A*02 05、A*0208、A*0209仅见于白人,A*0202、A*0214仅见于黑人,A*0211则可见于 东方人和南美印第安人[5-7]。我们的实验结果也支持这一观点,即HLA-A2等位 基因分布具有明显的种族和地域特征,还检出1例A*0211亚型并由测序证实,表 明 中国南方汉族群体存在该亚型。与白种人中A*0201占全部HLA-A2基因亚型90%以上这一情 形明显不同,中国南、北方汉族群体HLA-A2基因亚型种类较多,频率较为分散,但仍以A *0201为主,该两群体中A*0201,A*0206,A*0207三种亚型均占有一定比例,但频率 存在差别。

  由于中国南方汉族HLA-A*基因亚型具有异质性,提示既往血清学分型HLA-A2相符的器 官 移植供受体在基因水平上存在一定比例的错配。此外,同时对40例样本进行HLA-A、B 血清学分型,其中1份HLA-A2阳性标本(编号L27)血清学分型不能明确指定,因而强调对HL A-A2作基因分型以筛选合适供体,对异基因骨髓移植有重大意义[8]

  作者简介:田伟,男,30岁,医学硕士,助理研究员,从事HLA研究

  4 参考文献

  1,Bodmer J G,Marsh S G E,Albert E et al. Nomenclature for f actors of the HLA system.Hum Immunol,1997;53:98

  2,Kimura A,Sasazuli T. Eleventh international histocompatibility workshop re ference protocol for the HLA DNA typing technique. In:Tsuji K,Aizawa M,Sasazuki T eds. HLA 1991.New York: Oxford University Press,1992:397-419

  3,Ishikawa Y,Tokunaga K,Kashiwase K et al.Suquence-based typing of HLA-A2 alleles using a primer with an extra base mismatch.Hum Immunol,1995;4 2:315

  4,赵桐茂.HLA遗传学中的统计分析.见:赵桐茂主编.HLA分型原理及应用.上海:上 海科技出版社,1984:145-148

  5,Gao X,Jakobsen I B,Serjeantson S W. Characterization of the HLA-A poly morphi sm by locusspecific polymerase chain reaction amplification   and oligonucleotide hybridization. Hum Immunol,1994;41:267

  6,Browning M,Krause P. Genetic diversity of HLA-A2: Evolutionary and functio nal significance. Immunol Tody,1996;17:165

  7,Marsh S G E,Fauchet R M,Yang E K et al. Antigen society No.102: HLA -A2,-A68,-A68,-A69,-A9,-A23,-A24. In:Tsuji K, Aizawa M, Sasazuki T(eds). HLA 1991.New York:Oxford University,1992:2,285-289

  8,Fleischhauer K,Kernan N A,O'Reilly R J et al.Bone marrow-allog r aft rejection by T lymphocytes recognizing a single amino acid difference in HLA -B44. N Eng J Med,1990;323:1818

[收稿1999-06-30 修回1999-10-08]


作者: 风清扬 2009-2-21
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