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8月28日上午，医学部2006年研究生开学典礼在会议中心礼堂隆重举行。全国人大常委会副委员长、中国科协主席、医学部主任韩启德院士，北京大学常务副校长、医学部常务副主任柯杨教授，北京大学党委常委、医学部党委书记敖英芳教授，医学部副主任王宪教授、李鹰教授、方伟岗教授、姜保国教授，医学部党委副书记李文胜教授、顾芸教授以及各院（部）、临床医院、教学医院的领导出席了开学典礼。中国科学院院士童坦君教授应邀作为教师代表出席了典礼。开学典礼由王宪副主任主持。
首先，北京大学常务副校长、医学部常务副主任柯杨教授对2006级研究生同学表示了热烈欢迎，并介绍了2006年研究生新生和在职申请学位人员的情况：
硕士研究生：2006级硕士研究生共444人，其中内地学生420人，港澳台学生8人，留学生9人。另外有7名学生为保留资格，支边或从事工作1-2年后回校读研究生。444名学生中，医学科学（理学）学位研究生262人，临床或口腔医学专业学位182人。
博士研究生：2006级博士研究生350人，其中经公开招考录取175人，经推荐免试录取32人，经校内转博142人。另外有1名学生为保留资格，从事工作2年后回校读研究生。博士研究生350人中，医学科学（理学）学位研究生240人，临床或口腔医学专业学位110人。
在职申请学位人员：硕士147人，其中攻读医学科学（理学）学位80人，攻读临床/口腔医学专业学位67人。博士82人，其中攻读医学科学（理学）学位7人，攻读临床/口腔医学专业学位75人。
其后，来自第一临床医院的06级硕士瓦斯里江·瓦哈甫和药学院04级博士田晓明分别作为新生和在校生学生代表发言。瓦斯里江同学来自仅有1.2万人口的乌孜别克族，是第一个考入北医的乌孜别克人。在享受荣誉的同时，他也深感自己担负了重大的历史使命。作为研究生新生，瓦斯里江同学呼吁同学们要“十二分地珍惜这一难得学习机会，像爱护自己的眼睛一样爱护母校的荣誉，在学习上发扬自强不息的精神，”“不断增强自己的创新精神，提高自己的创新能力，为使自己成长为具有较强实践能力的创新型人才而努力奋斗,以自己的优异成绩为祖国和母校交一份满意的答卷。”
田晓明同学把自己在学校多年的学习生活体会浓缩成几点建议，来帮助大家尽快融入北医的学习氛围、适应北医的学习和生活。
教师代表、中国科学院院士童坦君教授结合自身经历，鼓励学子们在今后的学习中要勇于创新，要学习前辈们“敢为天下先”的精神。“金矿是需要开采的，能拿到多少金子要靠个人的努力和积累”。时不我待，童院士祝愿大家在北医积极进取，学业有成。
全国人大常委会副委员长、中国科协主席、医学部主任韩启德院士向2006届研究生们表示热烈的祝贺和欢迎。他强调：近年来，医学部的科学研究进步很快，这些成就的取得在很大程度上依赖于研究生们的科研攻关，研究生是北医科研的生力军，是我们建设世界一流大学必不可少的队伍。希望大家在开学之际，回顾过去，展望未来，“立志、博学、勤思、求学、修身”。
韩院士还重点谈了学风问题。他指出：科学家虽然不能成为社会道德标杆，但还是应该坚持科学家的主流品格——热爱科学、淡泊名利、追求一流科学。大家要多向童坦君院士、王海燕教授等秉持学风的先进人物学习，摒弃当前社会上追求功利的风气。同时，韩院士强调要注意预防科学不端，北医对科学不端的态度是非常严肃的，我们决不会包庇任何科学不端行为。对于科研博士学位认定问题，韩院士指出，SCI作为科研博士学位认定标准以来，效力很明显，很大程度上推动了北医的科研发展，但是随着时间的推移我们也发现一些问题。不完全取消SCI的要求，但又不唯SCI，将是今后我们研究生教育要探讨的一个重点问题。
最后，韩院士祝愿大家在北医快乐生活、在各自的学术领域学有所成！会场爆发出热烈的掌声。
开学典礼在“北医之歌”中圆满结束。
典礼结束后，柯杨常务副校长为2006级研究生新生上了“开学第一课”。