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2006年6月26-27日，2006届880名七年制、本科、高职高专毕业生在东院懿德楼一楼领取了毕业证书、学位证书和毕业纪念品，离开了母校，即将踏上工作岗位。除了极少部分学生正在办理离校手续外，绝大部分毕业生已文明离校。
今年是我院和上海交通大学合并后，第一届上海交通大学医学院毕业生毕业。虽然毕业生人数比往年略少，医学院对毕业生的文明离校工作与往年一样给予了高度重视。学生工作部认真贯彻医学院党委毕业生离校精神，俞立巍部长多次召集各学院学生总支书记开会，布置毕业前教育、文明离校和世界杯期间的安全稳定工作的有关事宜。此外，学生工作部还联系各职能部门会议，就毕业生离校的安排，做了具体的分工和协作。目前，毕业生签约率已达到94.66%，就业情况良好，毕业生思想稳定。
各部门、学院对毕业生离校工作高度的重视，积极主动地开展各项工作，同时，通过简化离校手续，处处为毕业生提供方便。组织部、学生工作部、团委、后勤中心、保健科等部门的同志不辞劳苦，为毕业生提供服务。各学院领导、毕业班辅导员不仅来到离校现场，还在毕业班学生中举行了形式各样的教育活动，如瑞金临床医学院向学生发放《告学生书》，在园区电子滚动牌上放入宣传内容，对学生进行文明离校的宣传；六院临床医学院在学生宣传、提供服务、加强管理上入手加大管理措施；口腔、九院临床医学院还向毕业生开设职业生涯、礼仪的讲座，确保毕业生能文明、安全离校。
经过各部门的通力合作和共同努力，本届毕业生离校期间没有任何违纪事件的发生，离校秩序井然。