美国德州莱斯大学(Rice University)及Baylor医学院(Baylor college of medicine)的研究人员,利用数学算法与X-ray结晶学的信息结合,破解蛋白质结构中会移动的部分结构(moving parts),有助于对结构生物学分类的厘清,并对引起
癌症或其它疾病蛋白质的活性区(active sites)有更多的了解。此研究发表于PNAS期刊。
Jianpeng Ma教授说:「这项技术对于较大、较复杂以及有弹性易弯由(flexible)的蛋白质结构区域的精细化(refinetment)有很大的帮助。利用数学算法及结晶学结果的信息对比,找到可能的蛋白质结构。」曾经是诺贝尔奖得主的哈佛大学教授William Lipscomb也表示:「这项研究对于蛋白质结构生物学领域的确是一项重大成就。」
蛋白质是由胺基酸一个一个串起来而形成的分子,目前的技术已能将这些胺基酸序列定义出来,但对于3D结构中较有弹性而会游动的部分,则仍然很难透过结晶学的技术直接解开,而这部分的蛋白质往往又是重要的功能区,例如:是酵素的催化中心或是讯息蛋白停靠的码头。因此,加速解开此区域的蛋白质结构,对于癌症或相关疾病的药物设计可说具有重要的意义。
Ma 教授说:「这些年来若没Billy Poon以及Xiaorui Chen这两位坚忍不拔的学生,日以继夜的配戴着特殊护目镜焚膏继晷的进行研究,不会有此革命性的研究出现。这个方法能改善许多蛋白质3D结构的译码,而事实上已证明此方法的适用性极高,并已解决许多膜蛋白(membrane proteins)结构的问题。」
作者:
2007-5-16