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今年6月中旬以来,我国大部分省区遭受洪涝灾害，尤其江苏、安徽、河南、江西、湖北、四川等地区洪涝更为严重。自然灾害给生长在这里的家种和野生药材带来严重影响。
1、大面积家种药材因受灾严重减产。据实地调查,今年果实类、花类药材减产达45%，严重者达80%以上。如牵牛子、无花果、草决明、薏苡米、菊花等，根茎类药材春种或多年生长的减产达40%左右，夏种则减产达70%以上,受灾的品种有白芷、白芍、白术、桔梗、牡丹、丹参、板蓝根、太子参、射干、知母、大黄、半夏等。受灾面积无法统计。这些药材价格今年都将会上扬。
2、部分野生药材因持续阴雨采收量减少或完全无法采收。持续近3个月的连阴雨，使得大部分野生药材无法采收和晾晒，如槐米、蛇麻子、绞股蓝、蝉蜕等。
3、受灾严重影响药材质量。如白芍、丹参、防风、元胡、山药、菊花、薏苡米等品种，必须有充足的光照才能使叶片肥厚、枝条生长充实、茎杆粗壮、根部发达，有机物质积累也会较多。而今年夏季长时间的阴雨，使得这些药材长期得不到光照，不但影响产量，而且质量大大降低。