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首页医源资料库在线期刊中华医学研究杂志2008年第8卷第2期

江浙沪汉族人群HLA-A*02组等位基因多态性分布

来源:《中华医学研究杂志》
摘要:【摘要】目的调查江浙沪汉族人群健康无关个体A*02组等位基因多态性并分析不同人群A*02组等位基因频率分布特征。方法利用Luminex技术对江浙沪地区3000名健康无关汉族人进行HLA-A*02组等位基因分型,可检出HLA命名委员会(WHONomenclature)2007年正式命名的所有HLA-A*02组等位基因,计算等位基因频率并与不同......

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【摘要】  目的 调查江浙沪汉族人群健康无关个体A*02组等位基因多态性并分析不同人群A*02组等位基因频率分布特征。方法 利用Luminex技术对江浙沪地区3000名健康无关汉族人进行HLA-A*02组等位基因分型,可检出HLA命名委员会(WHO Nomenclature)2007年正式命名的所有HLA-A*02组等位基因,计算等位基因频率并与不同人群多态性分布特征进行差异性比较。结果 江浙沪汉族人群共检出HLA-A*020101、A*020301、A*0202、A*020103和A*0245等5个等位基因, 其余等位基因未检出。3000名无关个体中HLA-A*02等位基因频率为0.3062,是频率分布最高的HLA-A基因座等位基因,其中HLA-A*020101等位基因频率最高,达到0.2787。江浙沪汉族人群HLA-A*02组各等位基因多态性分布与其他人群差异性比较均有统计学意义(P<0.05)。结论 HLA-A*02组各等位基因多态性分布具有明显的种族和地域特征。

【关键词】  江浙沪汉族人群;HLA-A*02组;基因频率


    Polymorphism of HLA- A*02 group alleles in the Jiangsu-Zhejiang-Shanghai Han population

    XIE Jun-hua, DU Ke-ming, JI Yun, et al. Shanghai Blood Center, Shanghai, 200051, China.

    【Abstract】  Objective  To investigate the polymorphism of HLA- A*02 group alleles in Jiangsu-Zhejiang-Shanghai Han population and analyze the characteristic of the allele frequency distribution in comparison with other populations. Methods  A total of 3,000 blood unrelated healthy individuals were genotyped for HLA- A*02 group alleles by Luminex technology. Unrelated individuals were collected from Chinese Han population in Jiangsu- Zhejiang-Shanghai area. All of HLA- A*02 group alleles which were nominated by HLA Nomenclature Committee (WHO Nomenclature) in 2007 were detected in this study. Allele frequency was calculated, and the polymorphism of allele frequency distribution was compared with other populations. Results  Five alleles including HLA- A*020101, A*020301, A*0202, A*020103 and A*0245 were detected in Jiangsu-Zhejiang-Shanghai Han population, but others were undetected. HLA- A*02 was the most common allele(0.3062)of HLA-A locus, and HLA- A*020101 was the most common allele (0.2787) of HLA- A*02 allele in 3,000 unrelated individuals. As compared with other populations, there was significant difference in polymorphism of HLA- A*02 group alleles of Jiangsu-Zhejiang-Shanghai Han population (P<0.05). Conclusion  The polymorphism of HLA- A*02 allele frequency distribution shows obviously ethnic and regional characteristic.

    【Key words】  Jiangsu-Zhejiang-Shanghai Han population; HLA-A*02 group; allele frequency

    HLA位于人类第6号染色体短臂6p21.3区域,长约3500kb,具有高度的遗传多态性,不同地域和种族多态性分布差异性较大[1]。HLA基因复合物的编码产物参与抗原识别、递呈及T细胞激活,在免疫应答的启动和免疫调节中起着非常重要的作用。HLA-A2于1965年被首次发现, 1967年被正式命名[2],是最常见的HLA-A座位抗原,也是目前发现的抗原编码等位基因数最多的一个,其在不同人种中均有较高的频率分布。本文采用流式荧光技术检测的方法,对3000名江浙沪地区健康汉族无关个体进行HLA-A*02组等位基因分型,并与不同人群进行多态性分布差异性比较,现将结果报告如下。

    1  材料与方法

    1.1  检测样本  江浙沪地区汉族人群无关个体3000名, 采集5ml静脉血于真空EDTA抗凝采集管,充分混匀,所有样本均知情同意。

    1.2  DNA抽提  采用美国Gentra公司试剂盒抽提DNA,具体操作见厂商说明书。

    1.3  基因分型  利用白细胞抗原系统流式(Luminex技术)检测试剂盒,戴诺生物技术(北京)有限公司提供,具体操作参照说明书。 

    1.4  统计学分析  利用基因直接计数法计算HLA-A*02组各等位基因频率。并运用软件SPSS10.0比较江浙沪汉族群体与其他不同人群HLA-A*02(*0201-0207)组等位基因多态性分布差异,由于在所比较人群中A*0207后等位基因非常罕见,意义不大,不纳入比较范围。

    2  结果

    2.1  江浙沪汉族人群HLA-A*02组等位基因频率分布  在所检3000名样本中共检出A*020101 、A*020103、A*0202、A*020301和A*0245等5种HLA-A*02组等位基因,其中A*020101 基因频率0.2787,详见表1。

    2.2  江浙沪汉族人群与不同人群HLA-A*02组等位基因多态性分布差异性比较  通过www.allelefrequencies.net查询得到不同人群HLA-A*02组等位基因频率分布数据,见表2。江浙沪汉族人群HLA-A*02组等位基因频率分布与中国南北汉族群体差异性比较有统计学意义(P<0.05), 与黑人、白人比较也有统计学意义(P<0.05),详见表2。表1  中国汉族群体HLA-A*02组等位基因频率分布(略)表2  江浙沪汉族与不同人群HLA-A*0201~0207多态性分布差异性比较(略)注:*P<0.05,有统计学意义

    3  讨论

    HLA作为个体组织细胞的遗传标志,在抗原识别、递呈、免疫应答与调控等方面,起着非常重要的作用,是影响造血干细胞移植成败和器官移植物长期存活的关键因素之一[3],因此对HLA抗原的等位基因进行分型显得尤为重要。本文采用Luminex技术对江浙沪地区3000名健康无关汉族人进行HLA-A*02组等位基因分型。

    从表1可见,3000名江浙沪汉族样本中共检出5个HLA-A*02组等位基因,A*0201和0203是常见等位基因,频率分别达到0.2792和0.0248。绝大多数人群HLA*0201是常见等位基因,在所有人种中均有检出。但中国南方汉族、黑人频率分布相对较低。A*0202在黑人中频率分布较高。A*0203、0207仅见于黄种人。A*0204在黑人中有分布,但频率也较低。A*0205在北方汉族、黑人和白人中有分布,但在沙特阿拉伯人(白人)和喀麦隆黑人频率分布较高(>5%)。

    从表2可见,江浙沪汉族人群HLA-A*02组等位基因频率分布与中国南北汉族群体和其他不同人群差异性比较均有统计学意义(P<0.05), 说明HLA-A*02组等位基因分布具有明显的地域和种族特征。

    综上所述,由于HLA-A*02等位基因多态性具有遗传异质性,提示既往血清学分型HLA-A2相符的器官移植供受体在基因水平上可能存在一定比例的错配[4],因而强调对HLA-A2作高分辨率基因分型以筛选合适供体,对异基因骨髓移植有重大意义[5]。

 

【参考文献】
  1 Feng ML, Ji Y, Lu Q,et al.Study on HLA Haplotypes in the Jiangshu-Zhejiang-Shanghai Han Population. Current Genomics,2005,6:109-114.

2 赵桐茂.HLA分型原理及应用.上海:上海科技出版社,1984,139.

3 Cho Y W,Cecka J M,Terasaki P I. HLA matching effects: better survival rates and graft quality. In: Terasaki P I, Cecka J M E ed. Clinical Transplants 1994. LOS Angeles: UCLA tissue typing laboratory,1995,435-449.

4 Bunce M,Fanning GC, Welsh KL. Comprehensive,serologically equivalent DNA typing for HLA-B by PCR using sequence-specific primers(PCR-SSP). Tissue Antigens,1995,45:81-90.

5 Browning M,Krause P. Genetic diversity of HLA-A2: Evolutionary and functio nal significance. Immunol Tody,1996,17:165.


作者单位:200051 上海,上海市血液中心

作者: 谢军华,杜可明,季 芸,杨建豪,黄 慧,沈 彤,冯 2008-7-4
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