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关于胚胎分裂转录控制信息的新算法
来源:Nature
摘要:对发育生物学家来说,果蝇胚胎分裂是研究身体成形的标准模型。这是一个被研究得很透彻的体系,但仍然缺乏信息的一个领域是转录控制,即在精确的时间和地点建立复杂表达模式的机制。该算法将关键转录因子的DNA结合特性和表达水平作为输入,并预测了任何给定的cis-调控序列在沿胚胎前-后轴上的每个空间位置都会产生的表达水......
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对发育生物学家来说,果蝇胚胎分裂是研究身体成形的标准模型。这是一个被研究得很透彻的体系,但仍然缺乏信息的一个领域是转录控制,即在精确的时间和地点建立复杂表达模式的机制。本期Nature上描述的一个新的计算框架在填补这一空白方面取得了很大进展。该算法将关键转录因子的DNA结合特性和表达水平作为输入,并预测了任何给定的cis-调控序列在沿胚胎前-后轴上的每个空间位置都会产生的表达水平。该算法具有普遍适用性,所以也许可证明对很多其他的蛋白-DNA相互作用体系也是有用的。
作者: 2008-2-2
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