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病原体应激基因在拟南芥基因组内的聚类

来源:国际农业生物技术周刊
摘要:Postnikova及同事在先前研究中利用不等长的表达序列标签(EST)制图,在拟南芥中开发了一个包含4935个与侵染或防御反应有关的基因图谱。作为该研究的延续,他们利用计算机分析了这些图谱,发现有1594个不同的基因簇分布在拟南芥全部染色体上,而染色体的联合调控有可能与病原体的宿主反应相关联。为了支持计算机生成信息......

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  美国农业部(USDA)科学家Olga  A.  Postnikova及同事在先前研究中利用不等长的表达序列标签(EST)制图,在拟南芥中开发了一个包含4935个与侵染或防御反应有关的基因图谱。作为该研究的延续,他们利用计算机分析了这些图谱,发现有1594个不同的基因簇分布在拟南芥全部染色体上,而染色体的联合调控有可能与病原体的宿主反应相关联。



  为了支持计算机生成信息,研究者随机选取了两个基因簇,并在拟南芥生态型Col-0和C24暴露在黄瓜花叶病毒时分析其表达水平。其中,Col-0对病毒表现出易感性,而包含优势性抗性基因RCY1的C24则表现相反。在C24体内,所有基因簇在受到病毒侵染时均表达了。这些结果显示,拟南芥的病原体应激基因可能是聚类并联合调控的。



  研究论文见:http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1744-7909.2011.01071.x/full
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