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在美英等发达国家，医院的抗生素使用率仅为２２％－２５％，世界卫生组织推荐的抗生素的院内使用率是３０％。而在我国，近５年内医院抗生素的使用率在６７％－８２％之间，抗生素类药物的费用更是占到全部药费的４０％。
调查后发现，多种因素的交织，导致抗生素滥用情况的出现。医护人员滥用抗生素，是造成中国抗生素使用过频过滥的最根本原因。浙江省卫生厅医政处的马伟杭处长说，抗生素的如此滥用，其背后深层次的原因是医务人员诊疗意识淡漠，对抗生素滥用的危害性认识不够，和医疗知识及诊疗经验的极度匮乏。
医生乱开药造成了抗生素药物的滥用。据了解，作为“处方药”的抗菌类药物，只能对病原体使用，而一些医院不做任何病源检查，仅凭医生的经验大范围使用抗生素来达到治疗效果。一些占有使用药品资源的优势群体，在抗生素的使用上点名开方。一旦病菌对药物产生抗体，只有不断地加大用药剂量，甚至使用各种高档抗菌新药，到后来再使用普通的药物治疗就起不到任何的作用了。
此外，对业务知识不熟悉也是一个重要因素。由于缺乏相关知识和诊疗经验，对病因判断不清，为求保险，许多医生就采用开广谱（相对窄谱而言，指并非针对某个具体菌种，而对多数菌种广泛有效）抗生素的办法。而开刀和手术使用抗生素的情况则几近泛滥。一份来自浙江某医院的抗生素使用月监测情况显示，该院手术病人抗生素的总使用率高达９９．３％。马伟杭认为，为防止感染，开刀时适当地用一些抗生素无可非议，但许多医院却普遍存在抗生素用得过好、过强，时间过长的情况。
由于前来医院就诊的疾病中，感染性疾病占到了绝大多数。因此，抗生素成为单类药品中使用范围广泛，使用比例最高的药物。一些医院将多开抗生素药物作为医院增加收入的好方法，而部分医护人员也出于经济利益的驱动，多开滥开抗生素药物，以获取回扣、谋取私利。根据不完全统计，目前我国使用量、销售量列在前１５位的药品中，有１０种是抗菌药物，我国住院病人抗菌药物的费用占总费用的５０％以上（国外一般在１５％－３０％）。
除此之外，患者对抗生素的知识匮乏，也是导致抗生素滥用的一个主要原因。
马伟杭说，目前社会上普遍存在着这样的一种认识：药用得越贵越好，病也就好的越快，对健康也就越有利。他说，许多患者一发烧就购买和选用抗生素，并且为了达到药到病除的效果，往往选用贵的、广谱的抗生素。而８０％的急性发烧是病毒性感染，抗生素根本无效。病人自己随意购买也是造成当前抗菌药物使用混乱的重要因素。因在医院取药价钱比市场要贵许多，许多患者仅凭对医学知识的一知半解和对药品宣传广告的盲目信任，直接将医生开具的处方拿到药店购买。“平价药店”的出现，更增加了群众自发购买药品的积极性。有的病人凭经验用药，有的甚至将处方过塑长期保留反复使用。专家指出，这种盲目的自己购药行为容易导致“因病购药，因药致病”的恶性循环。
分析产生这一误解的根本原因，马伟杭认为，除了患者对抗生素的使用不了解之外，社会负有很大的责任。
各类抗生素在各大药店均可以方便地买到，在客观上为患者盲目购药创造了条件。此外，主管部门和媒体也很少对如何正确使用抗生素，以及滥用抗生素可能带来的危害进行大规模宣传。
药品生产和商业企业的“混战”也为抗生素流行造就了条件。目前我国药品生产企业有４０００多家，流通企业数万家，而国内企业生产经营的抗生素大多是仿制药，重复生产严重。这直接导致药品流通渠道混乱、无序竞争严重。企业为了生存，就违规以广告（抗生素属处方药，按规定不准在大众媒体打广告）、
蒙骗、送回扣、价格战、产品说明书回避或少讲药品副作用和不良反应等方式，千方百计将抗生素卖到消费者手中。利益的链条也促使许多医院放弃医学原则，增加抗菌药物的使用量。有关人士称，这种“隐形”的使用现象最为可怕。另外我国目前农牧业中广泛滥用氯霉素等抗生素，人吃了这样的食品后，也会导致体内耐药情况的加剧。
由于我国目前对抗生素药物的使用没有立法，行政监督也很苍白，医生所拥有的处方权随意性较大。尽管每一次的使用剂量都在合理的范围之内，但对同一病人来说，经常使用就会带来无穷的危害。
专家强调说：滥用抗生素不只是“谁吃药、谁打针、谁受害”的问题。与一些传染性疾病相似的是：耐药细菌可以从一个地区传到另一个地区，从一个国家传到另一个国家。随着经济的发展，交通的日益便捷，人际交流的频繁，耐药菌种传播的速度将会越来越快，范围将会越来越广。在我国，药品不良反应特别是抗生素滥用所产生的毒副作用和耐药问题的严重程度已经超乎想像。尽管抗生素类药在不断升级，但仍跟不上疾病的发展。马伟杭说，医学工作者开发一种新的抗生素一般需要１０年左右的时间，需要花费数千万，乃至数十亿美元，而一代耐药菌的产生只要２年的时间，抗生素的研制速度远远赶不上耐药菌的繁殖速度。如果任由滥用现象继续下去，不久的将来，人类将面临没有抗生素可用的尴尬局面。
遏制抗生素需要各界的努力。目前，卫生部已明确要求抗生素的使用率小于５０％。国家食品药品监督管理局也决定从今年７月１日起，未列入非处方药药品目录的各种抗菌药物（包括抗生素和磺胺类、喹诺酮、抗结核、抗真菌药物），在全国范围内所有零售药店必须有执业医师处方才能销售。但至今国家还没有就如何使用抗生素出台过任何具体文件和限制措施。
浙江省于近日出台了全国首个《抗菌药物临床合理应用指导方案》，是全国最早制定抗菌药物合理应用指导方案的省份。浙江省卫生厅厅长李兰娟说，浙江省早在好几年前就开始着手抗生素使用情况及其危害的调研，此次更是在长期调研基础上，组织大量专家学者，在大量临床数据基础上制定了此方案。方案对医院临床抗菌药物的使用实行分线使用，逐级审批，并提出了预防性使用原则、经验治疗选药方案和联合用药原则。