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广州戊型病毒性肝炎暴发株和散发株部分序列比较

来源:www.medcyber.com
摘要:109-1122(广州)为了了解广州某部新兵连戊型病毒性肝炎(戊型肝炎)暴发流行的分子病毒学特征,并与当地散发毒株比较,以查找病原可能来源。研究者用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)法,......

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2006年08月09日 中华传染病杂志 2006 Vol.24 No.2 P.109-112 2 (广州)为了了解广州某部新兵连戊型病毒性肝炎(戊型肝炎)暴发流行的分子病毒学特征,并与当地散发毒株比较,以查找病原可能来源。研究者用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)法,对抗HEV-IgM阳性的34例暴发性戊型肝炎及46例散发性戊型肝炎患者的血清和粪便标本进行HEV RNA检测,并对HEV RNA阳性标本的基因开放读码框(ORF)2部分片段进行克隆测序分析。结果 34例暴发流行病例标本中检测出12株病毒,46例散发病例标本中检到2株。经克隆测序分析,各暴发毒株的核苷酸同源性为95.3%~100%;氨基酸同源性为94.0%~100%。且暴发毒株和散发毒株的核苷酸及氨基酸的同源性也较高,分别为95.3%~99.3%和94.0%~100%;暴发毒株和散发毒株与各型中的标准株相比,与Japl株同源性最高,其核苷酸同源性为92.0%~95.3%,氨基酸同源性为96.0%~100.0%。进化树分析提示本次戊型肝炎暴发流行病毒株与戊型肝炎病毒基因Ⅳ型距离最近。可见 本次戊型肝炎暴发流行的病原可能来于广州本地,广州地区戊型肝炎流行毒株属戊型肝炎基因型Ⅳ型。
作者: 2006-8-9
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