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针对皮肤科、妇科、眼科、口腔科等常见轻微感染性疾病，国家有关部门遴选了一些局部外用的抗菌药作为非处方药，这些不同剂型的外用抗菌药均标有OTC专用标志，患者可在药店药师指导下自行选购和应用。那么作为药店的药师，只有对外用非处方药的使用有一个全面的了解和认识，才能够正确指导患者用药。
由细菌感染的皮肤科疾病，如脓疱疮、疖肿、痤疮和酒渣鼻，可选用1%红霉素软膏、红霉素—过氧苯甲酰凝胶、鱼石脂软膏、维A酸软膏、1％呋喃西林乳膏、0.75％甲硝唑凝胶、复方新霉素软膏、杆菌肽软膏等。药师还要提醒患者，用药前清洁皮肤，一般使用2～3天即可，不可长期使用。
由真菌感染的念珠菌性阴道炎和由滴虫感染的滴虫性阴道炎，可选用克霉唑阴道片、软膏、药膜、栓剂；硝酸咪康唑栓剂；硝酸益康唑栓、制霉菌素泡腾片、栓剂；联苯苄唑阴道片、甲硝唑阴道泡腾片、复方甲硝唑栓、双唑泰栓、替硝唑阴道泡腾片、栓剂等。销售这些药时，药师需提醒患者勤换内裤，保持外阴清洁，最好是夫妻同治，而且要用够疗程，一般是7天一个疗程，必要时在下一月经周期结束时再用一个疗程。如果看到症状缓解便立刻停药，由于真菌的顽固性，疾病很容易再次复发。
由真菌感染的癣病，如手癣、足癣、体癣、股癣，可选用1％或3％克霉唑软膏、2％硝酸咪康唑乳膏、1％硝酸益康唑软膏、复方硝酸益康唑乳膏、1％盐酸特比萘芬乳膏、联苯苄唑凝胶、1％环吡酮胺软膏等。药师应提醒患者的是，除用药前清洗患处外，用药需要用满疗程（7～10天），真菌很“顽固”，如果用药疗程不足，会导致手癣、足癣反复发作。
由细菌感染的眼科疾病，如结膜炎、睑缘炎、睑腺炎(麦粒肿)，可选用0.5％盐酸金霉素眼膏、硫酸庆大霉素滴眼液、杆菌肽眼膏、0.25％氯霉素滴眼液、0.5％红霉素眼膏、10％磺胺醋酰钠滴眼液等。药师需要提醒患者，药水一次点一滴就够了，一般滴入下眼睑内，点药水后宜闭目；眼药膏点入下结膜囊内约半厘米长，眨动眼睛药膏便会自动覆盖在眼球表面；剩余的眼药水勿放置于高温、高湿或阳光直射处。
口腔科的炎症，如牙龈炎、牙周炎、口腔溃疡、慢性咽炎，可选用西地碘片、溶菌酶含片、克霉唑口腔药膜、地喹氯铵含片、枸橼酸氯己定口胶、醋酸地塞米松粘贴片、甲硝唑口腔粘贴片、0.5％甲硝唑含漱液、氯己定含漱液等。中药有养阴生肌散、冰硼散、西瓜霜等。药师需要提醒患者用药时间不宜过长，见效就应停药；用药时偶尔会有烧灼刺激感或过敏反应，如果这种情况较严重，则应立即停药，并向医师或药师咨询。
顾客购药后，药师还要提醒患者，在选购和使用外用抗菌药时，必须认真阅读药品说明书，同时细心观察药物不良反应。大多数外用抗菌药的不良反应较轻，常见的有局部刺激作用，如烧灼感、刺痛等；其次是过敏反应，如局部发生接触性皮炎，出现境界清楚的皮肤潮红、丘疹、水疱、渗出及自觉瘙痒，一旦出现这些反应，应立即停药，清洗患处。另外，如果患者正在使用其他药品，为避免药物相互作用，在使用前也应向医师或药师咨询。
另外，还需指出的是，小儿和老人应避免大面积使用外用抗菌药；孕妇及哺乳期妇女应慎用外用抗菌药，因为外用抗菌药可经皮肤吸收少许，同样有可能对胎儿和婴儿造成伤害；除眼用制剂外，其他外用抗菌药应避免接触眼睛和其他黏膜。